巴里島 是全世界最大回教國家印尼中唯一以印度教為主要信仰的島嶼。印度教從西元八到十五世紀間，慢慢流傳到巴里島，並融合當地原有信仰。現在巴里島的宗教正式名稱為“阿嘎瑪印度達瑪” Agama HinduDharma，又稱“聖水教”，因為聖水在各項重要慶典中扮演不可或缺的角色。

印度教相信只存在一個神明與其各種不同化身，對濕婆崇拜是巴里島民最重要的，她代表毀滅之神和重生者，通常以 Surya 太陽神姿態出現；然而另外兩個印度教大神，Brahma 創造之神大梵天和 Vishmu 保護之神昆濕奴，也受供奉，很多寺廟都有這三個神龕，在慶典儀式中，這些神龕則用不同顏色來表示，白色代表濕婆，大梵天是紅色，用黑色來表示昆濕奴。

巴里島祭司是相當受人尊敬的；祭司分成兩個階級，較高級的 Pedanda，主要任務是製造、分配聖水，且具有印度教神學知識；另一個是 Pemangku 的寺廟祭司，通常參與寺廟儀式比較多。同時巴里島人也盡力的維持宇宙和諧、宗旨、人類生存等系統，因此，神明與惡魔同時受到祭拜，以平衡宇宙。每日的祭拜儀式稱之為 Sajen，是將芭蕉葉摺成的小盤，裡面放著米飯、花和鹽的祭品，放在門外地上並灑上聖水，點上一柱香，天三次。宗教確實深刻影響著巴里島人的社交生活，每人都必須按教規行事，理想上最重要的是好行為、言語恰當、思考恰當，如果人都能確實遵守，則其他的規矩也就自然融入其中。

要暸解巴里島建築，首先要從暸解其宗教、宇宙觀開始。他們認為宇宙的秩序界定了建築形式，因此住屋、寺廟、村莊等建築，都可分為神、人、惡等三元世界領域，並成為建築設計與呈現的重要概念；而另外一個重要概念，人的身體也可以分成三個部份，即頭、軀幹和下半身，這個概念也直接影響了住家屋舍的呈現，這也是複合式的概念，一個結構的頭，就是最神聖的部份在東北方，是家祠所在地，手臂是睡覺的地方，中庭是肚臍，門則代表性器官，廚房是腿，穀倉是腳，垃圾坑則為肛門。而在傳統村落裡，可見到門的兩側都有 apit lawang 的小神龕，一進門就市一座牆，直接阻隔由外窺視中庭，而這道牆稱為 alingaling，用來阻撓一切惡靈進屋之用，因為島民深信惡靈是不懂轉彎的。

事實上巴里島上有數以千計的寺廟，有一個評估指出，大大小小的寺廟可能高達兩萬座。寺廟最普遍的名稱為 Pura，是指在公有地所建的寺廟；至於私人家中的寺廟，則稱為 Sanggeh 或 Marajan。主要三種寺廟類型包括地方寺廟、宗族寺廟、灌溉寺廟。雖然每座地方寺廟有其獨特風格，但仍有些共同點，有圍牆，大多有三個中庭，而三段式的區分，正反映宇宙的結構，最裡面中庭代表天堂，最外面中庭代表地獄，居中的則為中間地帶。而每個家庭在家裏的東北邊的角落，還有自己的家祠，通常只是幾片牆圍起來的神龕，供奉著祖先神靈。

印度教對於島民之影響，在峇里島的居民日常生活中，到處都可以發覺其息息相關之處。在峇里島人的生活中，他們相信有太陽神，月神，山神，湖神，海神，猴神，龜神...而且每種神也不止一位，因此他們信仰多神，而且神與人民共處於島上，峇里島人堅信他們就是神的後代，因此"神仙島"之稱呼也由此而來。其餘的多信奉回教、佛教、天主教或基督教等。在峇裡島，不同宗教的人都能和平共處。